Semasa Zaman Negara Berperang di Jepun, kumpulan ninja yang mempunyai nama berbeza turut bergelut dalam kegelapan. Pada malam terang bulan, Iga ninja Yamata (lakonan Masaune Sangen), Jinnai (lakonan Kashiwahara Shushi), Mouse dan yang lain secara tidak sengaja bertembung dengan lawan mereka semasa melakukan misi pengintip Dalam tempoh ini, sesuatu tiba-tiba terapung di langit bola api mengejutkan semua orang. Selepas Yematai pulang ke kampung, di bawah arahan ketua, dia pergi ke hutan untuk meneroka kebenaran tentang bola api itu. Dalam perjalanan, mereka bertemu Linlin (lakonan Mika Tsui) dan rakan-rakannya yang terdiri daripada puak yang sama, dan mereka semua berjalan bersama-sama. Akibatnya, di dalam hutan tebal, ninja Iga telah diserang oleh makhluk yang tidak dikenali. Lawan tangkas dan kuat, dan ninja dibunuh satu demi satu. Walaupun Yematai, Jinnei, Linlin dan yang lain melarikan diri secara kebetulan, mereka tidak tahu bahawa makhluk asing membiak secara liar. Untuk seketika, kampung Iga diracun dengan kejam, dan Yamatai serta yang lain juga menghadapi cabaran yang belum pernah terjadi sebelumnya...